Bioin 的所有文章

【R方差分析】蛋白质表达量多组比较

【R方差分析】蛋白质表达量多组比较

初始数据类似: 蛋白质组数据虽不是严格的正态分布,但目前最常用的检验方法还是T检验(两组比较)和方差分析(多组比较)。这个话题值得深究,这里不展开。 主要是求多个蛋白的Pvalue值或FDR,用于差异筛选。 Pvalue <-…
DIA技术及其软件工具介绍

DIA技术及其软件工具介绍

前言 关于蛋白质组学,你是不是已经听了太多公司的宣讲,介绍了一大堆的技术名词,反而越听越懵懂,脑袋一团乱麻?就和传话游戏一样,当我们接收了多手信息以后,得到的信息就越不准确。那么,何不自己看一看第一手信息呢?比如说DIA。 这里只推…
【宏蛋白质组】搜库工具简介与评估

【宏蛋白质组】搜库工具简介与评估

宏蛋白质组数据分析相对较难,不同于常规蛋白质组分析,因为数据库太大,无法直接进行搜库匹配,需要对数据库进行优化。整理了几个发表的宏蛋白搜库分析工具。具体效果如何,还需要测试。 1.ProteoStorm 发表:ProteoStorm…
蛋白质组学实验设计、质控与分析

蛋白质组学实验设计、质控与分析

1. 实验设计与技术路线 (1) 常用流程 流程 说明 1.材料收集 细胞、细胞上清、组织、血浆、血清、脑脊液、外泌体、尿液...... 2.定量技术 蛋白组:iTRAQ/TMT、LabelFree、SILAC、修饰;代谢组:靶向、…
蛋白组学生物信息资源列表

蛋白组学生物信息资源列表

前言 在工业界,天天做着重复的简单工作,已失去了对领域新技术发展的敏感性和好奇心,对技术人员来说这是件可怕的事情。因为没时间,也没兴趣看文献,不能掌握第一手资料,只能在网上找找已有的信息,随便翻翻大佬的博客,看看人家在做什么。这样也…